262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4694 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4694  cytochrome B561  100 
 
 		 174 aa  333  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  93.68 
 
 		 174 aa  315  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  92.98 
 
 		 181 aa  309  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  50.6 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  50.3 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0793  cytochrome B561  51.45 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0252714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0164  cytochrome B561  52.94 
 
 		 182 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  36.78 
 
 		 188 aa  94.4  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  39.01 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  34.22 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  35.47 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  36 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  34.48 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35.06 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  32.79 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  34.88 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  35.09 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  32.4 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  33.92 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  35.29 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  30.46 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  30.46 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  33.71 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  34.1 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  33.71 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  32.45 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  34.3 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  30.46 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  33.53 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  29.89 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  29.89 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.68 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  32.77 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.72 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  32.57 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  33.15 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  32.78 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  34.1 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  35.06 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.06 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  34.55 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  34.55 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  35.06 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  35.06 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  35.06 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  35.06 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  34.07 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  32.56 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  34.48 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  34.55 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  30.73 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  32.2 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  34.48 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  33.14 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  36.26 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  29.94 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  31.79 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  33.71 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  33.71 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  30.86 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.4 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  35.91 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  32.37 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.37 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  32.37 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.37 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  32.37 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3088  cytochrome B561  30.77 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76146  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  36.75 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  31.84 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  31.79 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  32.02 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  31.21 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  26.52 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  32 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  32.2 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  29.24 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  30.67 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  36.09 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  33.9 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  30.41 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.16 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  31.64 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  32.34 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  32.2 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  30.34 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  32.2 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  32.2 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  30.05 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  32.2 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  30.94 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  30.17 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  33.15 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.33 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  32.58 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  33.33 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  29.44 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>