296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0793 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0793  cytochrome B561  100 
 
 		 190 aa  381  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0252714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  52.38 
 
 		 174 aa  174  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  49.11 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  49.43 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  51.53 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0164  cytochrome B561  56.67 
 
 		 182 aa  158  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4694  cytochrome B561  51.45 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  35.59 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  32.77 
 
 		 177 aa  91.7  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  33.52 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  36.07 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  31.28 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  34.66 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.33 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  35.23 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  35.84 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  33.15 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  35.06 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  34.48 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  34.41 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  30.27 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  29.73 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  30.51 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  31.15 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  31.98 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  29.73 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  29.73 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  28.33 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  30.56 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  31.43 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  32.09 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  34.32 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  32.58 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  31.07 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  34.62 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.14 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1874  cytochrome B561  37.29 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  29.19 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  32.57 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  36.47 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  30.98 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  33.14 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  32.6 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  34.05 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  32.95 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  27.27 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  32.26 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  29.67 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  33.33 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  28.25 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  30.69 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  30.69 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  31.69 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  32.45 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  30.69 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0183  putative cytochrome b561  29.41 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0204  cytochrome b561, putative  29.41 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.437761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  29.12 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  32.76 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  28.49 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  34.95 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  30 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1568  hypothetical protein  36.84 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  28.09 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  30.94 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  31.52 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  30.23 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  33.7 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  31.18 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  30.05 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  30.39 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30.39 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  32.2 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  30.77 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  32.94 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  31.61 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  31.32 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  31.61 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  30.48 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  29.67 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  31.46 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  30.34 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  28.49 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  28.65 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  31.61 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  30.46 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  28.88 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  32.39 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  32.16 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.28 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  30.46 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  33.15 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  31.67 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  31.07 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  31.67 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>