255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1874 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1874  cytochrome B561  100 
 
 
205 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  36.14 
 
 
177 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  37.95 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  35.06 
 
 
191 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  36.76 
 
 
184 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  33.53 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  31.75 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  30.81 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  34.3 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  34.5 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  35.47 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  38.92 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  33.33 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  35.2 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  33.15 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  36.93 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  29.61 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  34.48 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  34.5 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  35.29 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  31.28 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  31.84 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  31.18 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  31.18 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  31.18 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  32.24 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  39.44 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  31.18 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  31.18 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  33.71 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  31.67 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0793  cytochrome B561  37.29 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0252714 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.96 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  35.33 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.71 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  34.71 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.46 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  30.39 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  34.71 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  34.71 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  32.02 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.71 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  34.1 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  32.75 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  36.36 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.69 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  32.02 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  33.33 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  32.02 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  33.33 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  32.02 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  33.33 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  37.78 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  33.33 
 
 
178 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  31.76 
 
 
178 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  32.35 
 
 
178 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  30.94 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  33.52 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  35 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  31.46 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  32.04 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  31.15 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  30.69 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  33.52 
 
 
184 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  35.86 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4694  cytochrome B561  35.75 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  36.75 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  31.46 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  37.02 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  29.38 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0204  cytochrome b561, putative  32.95 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.437761  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0183  putative cytochrome b561  32.95 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  35 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  35.43 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  30.39 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  34.59 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  35.14 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  34.42 
 
 
184 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  32 
 
 
175 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  33.15 
 
 
184 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0380  cytochrome B561  37.43 
 
 
189 aa  62  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  33.15 
 
 
184 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  33.15 
 
 
184 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1966  cytochrome B561  39.64 
 
 
196 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  35.33 
 
 
188 aa  61.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2328  cytochrome b561 family protein  39.64 
 
 
196 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  33.9 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  30.18 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  34.46 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  29.84 
 
 
187 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  29.67 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  34.66 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  35.71 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  34.66 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  35.06 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  35.63 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  36.46 
 
 
183 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  34.66 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  35.8 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  33.33 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>