205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0204 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0204  cytochrome b561, putative  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.437761  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0183  putative cytochrome b561  100 
 
 		 193 aa  371  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3034  cytochrome B561  71.98 
 
 		 188 aa  237  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0170  cytochrome b561, putative  58.29 
 
 		 192 aa  206  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.397552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0151  putative cytochrome b561  58.29 
 
 		 192 aa  206  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232004  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3330  cytochrome B561  48.33 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0137  cytochrome B561  49.42 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0274557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2563  cytochrome B561  44 
 
 		 199 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280781  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3234  cytochrome B561  43.43 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.730011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0241  cytochrome B561  38.25 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.263387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1412  cytochrome B561  31.21 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  27.84 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  27.27 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  31.79 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  28.11 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  28.57 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  27.89 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  30.9 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  30.77 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  28.8 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  34.27 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  27.32 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  33.14 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  30.3 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  30.22 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  30.68 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  29.82 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11530  Cytochrome B561 family protein  35.43 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473896  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  28.99 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  30.54 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  29.63 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  30.56 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  29.78 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  31.48 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  30.46 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  30.46 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  30 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  29.89 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  29.89 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  30 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  29.05 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  28.09 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  30 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  30 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  28.65 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  28.65 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  29.59 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4003  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.94 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288533  normal  0.223807 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  28.65 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  30 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  28.32 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  29.59 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  29.59 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  29.59 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.89 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  28.49 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  28.65 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  28.11 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  28.48 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  31.06 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  32.52 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  31.06 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.74 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  29.65 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  31.06 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.06 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.06 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  31.06 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  28.41 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  27.84 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  31.55 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  28.9 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  30.48 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  32.02 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  31.02 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  28.81 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  31.03 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  29.05 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  30.91 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  30.65 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  29.05 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  28.98 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  30.91 
 
 		 178 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  26.74 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  28.75 
 
 		 178 aa  51.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  31.9 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  29.82 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  30.43 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2328  cytochrome b561 family protein  26.62 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  27.33 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1966  cytochrome B561  26.62 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  24.46 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  29.41 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>