137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3330 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3330  cytochrome B561  100 
 
 		 188 aa  367  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0137  cytochrome B561  71.96 
 
 		 189 aa  266  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0274557 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0204  cytochrome b561, putative  48.33 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.437761  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0183  putative cytochrome b561  48.33 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3234  cytochrome B561  47.67 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.730011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2563  cytochrome B561  43.89 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280781  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0170  cytochrome b561, putative  43.55 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.397552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0151  putative cytochrome b561  43.55 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232004  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3034  cytochrome B561  44.13 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0241  cytochrome B561  40.91 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.263387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  30 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1412  cytochrome B561  29.24 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  34.46 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.07 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  31.03 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  31.03 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  31.61 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  32.07 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3332  cytochrome B561  35.5 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  30.86 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  31.03 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  30.23 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  28.16 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  28.16 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  30.86 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.16 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  31.25 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.16 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.16 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  28.16 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  28.16 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.16 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  25.86 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  30.81 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  36.29 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  29.31 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  30.23 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  29.44 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  29.89 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  28.89 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  29.78 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  27.72 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  28.25 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  28.49 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  25.52 
 
 		 410 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  27.01 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  27.01 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  35.88 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  27.01 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  29.89 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  29.55 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  25.86 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  27.59 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  30.11 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  30.6 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  28.49 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  23.44 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  28.57 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  28.9 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  32.18 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  26.11 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11530  Cytochrome B561 family protein  38.04 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473896  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  31.38 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  28.41 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  28.16 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  28.26 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  29.1 
 
 		 177 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  28.82 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  28.74 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  28.9 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  28.12 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  28.8 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  27.27 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  28.89 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.89 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  31.28 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  30.46 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  25.58 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  25.41 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  25.41 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  26.32 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  28.89 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  27.65 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  25.41 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  25.41 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  33.9 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  28.89 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  28.89 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  28.89 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  28.89 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  29.83 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  30.51 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  25.41 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  28.32 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  28.74 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  25.52 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  24.29 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>