241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1412 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1412  cytochrome B561  100 
 
 
174 aa  348  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0204  cytochrome b561, putative  31.21 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.437761  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0183  putative cytochrome b561  31.21 
 
 
193 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2563  cytochrome B561  34.46 
 
 
199 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280781  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0137  cytochrome B561  32.16 
 
 
189 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0274557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  29.94 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0241  cytochrome B561  37.02 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.263387  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  31.84 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3034  cytochrome B561  32.2 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0170  cytochrome b561, putative  28.89 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.397552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0151  putative cytochrome b561  28.89 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  31.43 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3330  cytochrome B561  29.24 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  32.39 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  31.61 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  31.61 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  31.79 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  27.22 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  31.64 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  36.41 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3234  cytochrome B561  31.07 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.730011  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  32.24 
 
 
196 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  35.87 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  31.07 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  35.87 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  35.87 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11530  Cytochrome B561 family protein  43.02 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473896  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  31.07 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  30.06 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  30.54 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  28.8 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  30.81 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  31.07 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.18 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  34.29 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  28.8 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.69 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.69 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.69 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  31.69 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.69 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  32.78 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  31.69 
 
 
188 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  31.69 
 
 
188 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  31.69 
 
 
188 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  30 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.15 
 
 
213 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  27.6 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  31.64 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  31.67 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  31.61 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  25.75 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  28 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  32.58 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  26.2 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  30.23 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  32.6 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.23 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  27.87 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  30.23 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  30.23 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  30.23 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  30.23 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  30.81 
 
 
397 aa  64.3  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  30.23 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  28.8 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  29.82 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2450  cytochrome B561  30.06 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  29.73 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  28.26 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  26.86 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  27.87 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  28.26 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  32.2 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  32.43 
 
 
203 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  32 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  30.05 
 
 
190 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  26.26 
 
 
184 aa  61.6  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  26.86 
 
 
175 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  31.03 
 
 
193 aa  61.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  29.07 
 
 
195 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  29.28 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  30.27 
 
 
185 aa  60.8  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  29.28 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  30.11 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  29.19 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2129  cytochrome B561  32.29 
 
 
198 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000482046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  28.73 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  30.11 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  28.24 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  32.22 
 
 
420 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  30.81 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.11 
 
 
222 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  28.26 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  30.94 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2596  cytochrome B561  27.91 
 
 
190 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.047019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  31.58 
 
 
199 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  28.5 
 
 
188 aa  58.9  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  28.11 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2736  cytochrome B561  29.31 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>