215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0241 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0241  cytochrome B561  100 
 
 
195 aa  390  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.263387  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0137  cytochrome B561  40.21 
 
 
189 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0274557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3330  cytochrome B561  40.91 
 
 
188 aa  121  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2563  cytochrome B561  37.29 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280781  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0183  putative cytochrome b561  37.43 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3234  cytochrome B561  43.65 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.730011  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0204  cytochrome b561, putative  38.25 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.437761  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3034  cytochrome B561  39.46 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1412  cytochrome B561  37.02 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  30.64 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  31.95 
 
 
191 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0170  cytochrome b561, putative  31.69 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.397552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0151  putative cytochrome b561  31.69 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232004  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  29.14 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  28.41 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  30.51 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  31.98 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  31.07 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  28.49 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  31.07 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  35.19 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  28.65 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  31.18 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.95 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  32.04 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  32.04 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  31.07 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  30.51 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  32.04 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  29.05 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  25.82 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  29.73 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  25.84 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  29.94 
 
 
183 aa  62  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  27.84 
 
 
183 aa  61.6  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  29.44 
 
 
184 aa  61.6  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  27.65 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  29.73 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  26.06 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  28.26 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  27.23 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  31.18 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  27.27 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  27.69 
 
 
196 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  26.06 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  31.07 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  28.96 
 
 
182 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  31.98 
 
 
178 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  32.2 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2822  cytochrome B561  29.61 
 
 
184 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  31.31 
 
 
201 aa  58.5  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  30.27 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  31.4 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.27 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  27.22 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  26.86 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  28.96 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  29.28 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3088  cytochrome B561  26.67 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76146  normal  0.0516175 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  27.22 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  27.22 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.67 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  30.27 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  27.22 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  27.78 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  30.27 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  30.27 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  30.27 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  29.31 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  28.88 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  29.73 
 
 
177 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  25.99 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  26.78 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  26.67 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  26.78 
 
 
182 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.67 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.67 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.67 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  28.02 
 
 
183 aa  55.1  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.67 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  27.81 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  27.49 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  28.34 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  30.26 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  28.57 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  25.53 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  26.11 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  28.34 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  29.41 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  25.27 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  27.03 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  28.34 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  29.29 
 
 
406 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0380  cytochrome B561  34.21 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  28.96 
 
 
190 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  24.85 
 
 
175 aa  52  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  30.41 
 
 
421 aa  52  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  28.96 
 
 
192 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  28.96 
 
 
190 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  25.91 
 
 
195 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>