244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3034 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3034  cytochrome B561  100 
 
 
188 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0204  cytochrome b561, putative  71.98 
 
 
186 aa  266  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.437761  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0183  putative cytochrome b561  71.98 
 
 
193 aa  266  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0170  cytochrome b561, putative  55.73 
 
 
192 aa  201  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.397552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0151  putative cytochrome b561  55.73 
 
 
192 aa  201  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232004  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0137  cytochrome B561  47.22 
 
 
189 aa  151  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0274557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3330  cytochrome B561  44.13 
 
 
188 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2563  cytochrome B561  43.75 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280781  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3234  cytochrome B561  42.53 
 
 
177 aa  117  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.730011  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0241  cytochrome B561  39.46 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.263387  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1412  cytochrome B561  32.37 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  30.43 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  29.19 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  36.36 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  34.76 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.15 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.15 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.15 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  31.15 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.15 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.15 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  33.33 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  36.36 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  30.6 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  30.6 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  30.6 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  31.49 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  35.83 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  29.79 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  32.42 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  33.14 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  31.67 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.29 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  31.61 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  30.81 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  29.21 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.2 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  32.2 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  33.54 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.2 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  32.2 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  32.2 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  31.29 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  26.52 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  31.28 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  32.92 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  30.9 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  25.7 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  27.47 
 
 
195 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  31.61 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  30.22 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  29.61 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  30.56 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02672  cytochrome b561, putative  28.72 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  31.89 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  31.4 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  31.35 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  29.61 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  30 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  28.96 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  28.96 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  28.49 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  30.6 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11530  Cytochrome B561 family protein  37.71 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473896  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  31.35 
 
 
192 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  30.22 
 
 
190 aa  61.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  29.31 
 
 
190 aa  61.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  30.17 
 
 
189 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  30.05 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  30.51 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  26.09 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  29.14 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  28.06 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  29.07 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  29.19 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  29.19 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4003  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.83 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288533  normal  0.223807 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  30.64 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  28.49 
 
 
184 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  29.19 
 
 
183 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  28.49 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2328  cytochrome b561 family protein  29.1 
 
 
196 aa  58.2  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1966  cytochrome B561  29.1 
 
 
196 aa  58.2  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  28.49 
 
 
193 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  30.64 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  33.87 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  30.64 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  28.02 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.64 
 
 
177 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  30.64 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  28.16 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  30.64 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  30.64 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  30.23 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  28.9 
 
 
178 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  27.98 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  32.98 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  28.07 
 
 
177 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  28.32 
 
 
186 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  28.49 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>