More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2328 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1966  cytochrome B561  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2328  cytochrome b561 family protein  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  48.24 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  41.04 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  38.29 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  38.51 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  40.59 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  33.33 
 
 		 196 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  34.29 
 
 		 183 aa  98.2  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  35.03 
 
 		 195 aa  94.4  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2536  cytochrome B561  36.96 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  33.71 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  32.39 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  35.33 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  37.08 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  35.59 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  38.55 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  32.57 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  38.55 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  35.14 
 
 		 181 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.26 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.26 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  32.26 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.26 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.26 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  35.23 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  32.95 
 
 		 184 aa  87.8  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  31.72 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  31.72 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.61 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  31.72 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  30.68 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.61 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  35.29 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  32.04 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  28.49 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  33.14 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  33.53 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  38.2 
 
 		 174 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  35 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  31.11 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  34.66 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  31.03 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  31.61 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  30.46 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  32.58 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  33.33 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  34.1 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  29.02 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  31.98 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  31.87 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  31.84 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  28.33 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  31.25 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  28.57 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  30.99 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  32.76 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  28.57 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  30.64 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  28.57 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  33.14 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  34.48 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  33.33 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  31.82 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  31.82 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  30.29 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  31.82 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  28.99 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  31.43 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  33.14 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  30.46 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  30.46 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.46 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  32.16 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  33.91 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  30.46 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  30.46 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.46 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  32.76 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.9 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  29.48 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  33.14 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  29.28 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  31.25 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  30.73 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  31.25 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.46 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  29.69 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  27.12 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.46 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  32.95 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  31.28 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  29.17 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  28.12 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  28.81 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  31.69 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  31.69 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  31.07 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  32.57 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  31.69 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>