237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5215 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  100 
 
 		 174 aa  334  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  91.23 
 
 		 181 aa  303  8.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4694  cytochrome B561  93.68 
 
 		 174 aa  290  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  52.35 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  51.79 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0793  cytochrome B561  52.38 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0252714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0164  cytochrome B561  53.85 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  37.36 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  39.31 
 
 		 208 aa  84.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  36.63 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  35.43 
 
 		 196 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  36.99 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  35.03 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  34.5 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  32.77 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  35.47 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  34.86 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  34.3 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.26 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  34.68 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  33.15 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  32 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  31.43 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  33.52 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  31.43 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  32.2 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  33.52 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  31.43 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  31.82 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  29.89 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  32.39 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  29.89 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  34.86 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  35.26 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  32.57 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  34.86 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  34.86 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  34.86 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.26 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  34.68 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  29.89 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  34.83 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  30.39 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  33.15 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  33.15 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  35.67 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  29.31 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  32.95 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  31.84 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  29.31 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  34.68 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  33.14 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  32 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  32.73 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  33.53 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  29.21 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  31.61 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  32 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  31.98 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  32.73 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  32.73 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  31.82 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0204  cytochrome b561, putative  31.48 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.437761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  33.52 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.9 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0183  putative cytochrome b561  31.48 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  31.98 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  27.33 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  31.21 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  29.94 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  31.64 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  34.94 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  29.51 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  31.64 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  30.9 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  35.23 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.9 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  29.82 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.9 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.9 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  31.98 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  31.07 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  34.64 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.9 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  30.06 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  31.79 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  31.79 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.79 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.79 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  31.79 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  30.34 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  30.34 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  31.03 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  31.21 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  30.34 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  31.64 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  34.29 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  31.64 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  31.64 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>