More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1755 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1755  cytochrome b561  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000553481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  80.68 
 
 		 176 aa  303  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  83.52 
 
 		 176 aa  300  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  83.52 
 
 		 176 aa  300  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  82.95 
 
 		 176 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  82.95 
 
 		 176 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  82.95 
 
 		 176 aa  298  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1642  cytochrome b561  95.74 
 
 		 188 aa  296  8e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1500  cytochrome b561  95.74 
 
 		 188 aa  296  8e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1598  cytochrome b561  95.21 
 
 		 188 aa  296  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01374  cytochrome b561  95.45 
 
 		 176 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782687  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2228  cytochrome B561  95.45 
 
 		 176 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.013498  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01386  hypothetical protein  95.45 
 
 		 176 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2023  cytochrome b561  95.45 
 
 		 176 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362205 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2241  cytochrome b561  95.45 
 
 		 176 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3256  cytochrome b561  67.05 
 
 		 176 aa  227  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0918  cytochrome b561  63.3 
 
 		 187 aa  226  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.974416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3390  cytochrome b561  65.91 
 
 		 176 aa  224  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  51.98 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  51.12 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  48.02 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  50.56 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  43.43 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  43.43 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  43.43 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  43.43 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  43.43 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  43.43 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  43.43 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  43.43 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  43.18 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  45.98 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  42.05 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  45.4 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  45.4 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  42.29 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  42.29 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  42.29 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  39.77 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0972  cytochrome B561  47.62 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  39.2 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  44.19 
 
 		 181 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  38.51 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  38.86 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  35.03 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  38.29 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  41.52 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  44.83 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  44.83 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1341  cytochrome B561  44.25 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  44.83 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  39.18 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1928  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  44.25 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  38.67 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  38.42 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  37.08 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  37.79 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  38.6 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  36.16 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  37.71 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  42.29 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  34.48 
 
 		 196 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  34.3 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  35.36 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.36 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  35.36 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  35.36 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.36 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  35.33 
 
 		 225 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  34.24 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  41.28 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  41.28 
 
 		 174 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  36.26 
 
 		 190 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  32.2 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  39.33 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  38.76 
 
 		 178 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  36 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  35.87 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  37.14 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  37.14 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.88 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  37.14 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1736  cytochrome B561  40.23 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874237  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  30.46 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  35.43 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.86 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  33.14 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  30.56 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1077  putative cytochrome b561  38.07 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401014  normal  0.0399312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  35.59 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  27.68 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  30.46 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  29.32 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  34.04 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  30.6 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  31.64 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2736  cytochrome B561  31.22 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  29.38 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  27.84 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  29.94 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>