More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0705 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  95.19 
 
 		 187 aa  361  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  76.63 
 
 		 186 aa  291  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  76.76 
 
 		 186 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  76.76 
 
 		 186 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  71.2 
 
 		 191 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  70.68 
 
 		 191 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  75.54 
 
 		 186 aa  270  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  75.54 
 
 		 186 aa  270  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  75 
 
 		 186 aa  268  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  80.21 
 
 		 187 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  77.3 
 
 		 207 aa  267  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  72.78 
 
 		 193 aa  267  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  77.3 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  77.3 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  77.84 
 
 		 207 aa  265  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  75.54 
 
 		 186 aa  263  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  77.3 
 
 		 186 aa  261  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  77.3 
 
 		 186 aa  261  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  76.09 
 
 		 186 aa  254  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  75 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  58.66 
 
 		 189 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  55.87 
 
 		 190 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  53.16 
 
 		 190 aa  198  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  57.58 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  52.57 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  46.91 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  49.34 
 
 		 194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  48.85 
 
 		 190 aa  154  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  45.75 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  49.01 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  42.77 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  49.01 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  48.45 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  45.45 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  44.74 
 
 		 190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  46.05 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  35.33 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  38.89 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  32.04 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  35.9 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  35.03 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  36.94 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  35.96 
 
 		 191 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  34.5 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  29.75 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  33.76 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  29.33 
 
 		 421 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  29.89 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  31.21 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  29.94 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  32.14 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  31.69 
 
 		 441 aa  79  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  31.71 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  35.65 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  25.6 
 
 		 416 aa  78.2  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  36.59 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  30.22 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  35.62 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  32.34 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  31.67 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  35.04 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  35.77 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0569  YceI family protein  29.83 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  32.97 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  29.61 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  30.53 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  36.43 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  34.92 
 
 		 204 aa  72  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  28.09 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  40.22 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  32.04 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  33.1 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  33.05 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  30.17 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  32.14 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  30.5 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  30.5 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  32.52 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  31.25 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  29.03 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  29.05 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  32.81 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  29.91 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  32.16 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  30.72 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  32.22 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  30.28 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  26.97 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  32.22 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  30.13 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  27.71 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  28.5 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  31.5 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  28.76 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  30.3 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  28.24 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  31.03 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  37.11 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>