More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2962 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  100 
 
 		 190 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  94.74 
 
 		 190 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  85.79 
 
 		 189 aa  328  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  57.89 
 
 		 190 aa  215  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  56.45 
 
 		 191 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  56.42 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  55.87 
 
 		 187 aa  200  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  53.89 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  49.74 
 
 		 191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  54.27 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  53.05 
 
 		 193 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  55.28 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  55.28 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  55.97 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  55.28 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  53.37 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  53.37 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  55.28 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  54.66 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  54.27 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  54.27 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  54.27 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  54.32 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  54.32 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  54.32 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  50.31 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  47.71 
 
 		 192 aa  154  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  43.21 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  41.94 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  43.2 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  44.44 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  46.75 
 
 		 196 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  42.13 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  45.45 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  42.69 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  41.03 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  35 
 
 		 183 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  37.09 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  41.67 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  34.62 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  29.79 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  37.72 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  32.14 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  35.33 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  29.55 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  33.33 
 
 		 190 aa  89  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  29.63 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  30.25 
 
 		 191 aa  84.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  38.6 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  32.45 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  32.17 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  32.63 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  30.06 
 
 		 441 aa  81.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  31.77 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  28.19 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  31.78 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  29.32 
 
 		 420 aa  75.1  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  30.82 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  31.37 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  29.7 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  31.58 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  31.75 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  30.65 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  32.93 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  32.2 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  29.29 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  30.47 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  28.48 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  32.5 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  29.23 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  31.67 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  27.52 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  31.62 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  32.2 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  31.62 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  31.62 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  31.62 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  31.62 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  31.62 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  31.62 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  31.62 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  31.62 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  28.1 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  29.7 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  34.45 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  23.91 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  31.67 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  28.99 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  29.91 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  30.95 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  29.73 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  29.66 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  27.45 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  29.1 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  29.89 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  35.25 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  29.59 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>