More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4184 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  73.16 
 
 		 191 aa  288  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  74.35 
 
 		 191 aa  288  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  72.78 
 
 		 187 aa  273  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  70.88 
 
 		 187 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  65 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  68.32 
 
 		 186 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  68.32 
 
 		 186 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  67.7 
 
 		 186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  68.55 
 
 		 186 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  70.44 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  63.54 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  63.54 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  64.09 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  64.09 
 
 		 207 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  65.19 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  64.09 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  64.64 
 
 		 186 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  64.64 
 
 		 186 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  67.08 
 
 		 186 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  66.46 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  53.67 
 
 		 190 aa  190  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  49.74 
 
 		 189 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  49.21 
 
 		 190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  53.05 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  49.46 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  48.85 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  46.71 
 
 		 194 aa  151  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  47.44 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  46.3 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  46.71 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  44.1 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  44.16 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  46.71 
 
 		 190 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  47.2 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  40.22 
 
 		 183 aa  137  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  44.74 
 
 		 196 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  38.89 
 
 		 185 aa  120  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  34.08 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  35.67 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  35.67 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  35.98 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  31.94 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  32.95 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  33.54 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  30.38 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  32.75 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  32.1 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  29.33 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  28.57 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  33.91 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  36.22 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  30.23 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  30.5 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  38.89 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  28.4 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  31.95 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  27.92 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  40.86 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  31.97 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  27.65 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  32.52 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  29.08 
 
 		 441 aa  71.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  29.59 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  37.78 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  31.71 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  42.86 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  30.51 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  29.11 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  38.3 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  33.11 
 
 		 410 aa  68.9  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  31.4 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  27.06 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  33.33 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  37.5 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  36.96 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  34.44 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  25.95 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.94 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  28.25 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0569  YceI family protein  29.51 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  33.61 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  28.57 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  33.1 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  27.96 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  30.5 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  35.42 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  35.42 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  37.23 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  37.23 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  23.37 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  35.42 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>