233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0351 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  60.59 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  50.29 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  50 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  46.2 
 
 		 172 aa  158  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  44.44 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  45.78 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  39.89 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  44.44 
 
 		 188 aa  136  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  34.17 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  31.72 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  32.76 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  36.04 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  32.56 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  32.02 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  28 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  32.6 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  33.1 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  28.28 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  27.47 
 
 		 534 aa  65.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  25 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  28.93 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  28.9 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  31.11 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  29.45 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  35.25 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  30 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  27.27 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  31.68 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  34.34 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  35.1 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  27.86 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  33.08 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  27.66 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  30.71 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  27.66 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  37.8 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  26.43 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  27.27 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  32.77 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  27.27 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  27.27 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  27.27 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  27.27 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  28.05 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  34.65 
 
 		 175 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  28.86 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  30.6 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  30.08 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  38.82 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  36.08 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  26.11 
 
 		 190 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  33.71 
 
 		 184 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  24.47 
 
 		 185 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  36.05 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  33.06 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  30.86 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  25.48 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  25.27 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  37.89 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  34.48 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  47.37 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  32.46 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  47.37 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  26.43 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  39.44 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  28.4 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  34.83 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  27.11 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  32.46 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  31.54 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  23.61 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  29.73 
 
 		 177 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  28.14 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  25.71 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  28.12 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  33.33 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  23.65 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  43.64 
 
 		 181 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  32.29 
 
 		 192 aa  48.9  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  35.85 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  29.41 
 
 		 175 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  45.83 
 
 		 186 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  46.3 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  42.11 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  30.84 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  30.84 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  30.84 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  36.36 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  30.17 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  29.01 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  37.5 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  49.12 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  30.84 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  32.58 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  33.04 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>