More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3540 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  43.03 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  42.13 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  40.11 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  39.29 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  38.89 
 
 		 183 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  43.31 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  41.57 
 
 		 189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  40.74 
 
 		 186 aa  128  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  38.89 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  38.33 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  36.78 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  37.36 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  37.22 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  37.22 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  39.38 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  38.46 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  35.56 
 
 		 186 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  39.33 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  39.33 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  38 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  38.22 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  36.88 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  36.25 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  36.25 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  36.67 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  36.67 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  38.67 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  38.61 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  38.61 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  38.61 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  38.61 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  38.61 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  38.61 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  34.39 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  36.25 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  34.78 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  36.25 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  34.64 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  32.04 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  34.44 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  31.58 
 
 		 189 aa  91.3  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  30.91 
 
 		 191 aa  90.9  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  30.38 
 
 		 191 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  30.56 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  31.02 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  33.76 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  30.43 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  29.41 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  28.76 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  30.97 
 
 		 421 aa  78.6  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  30.41 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  29.19 
 
 		 416 aa  75.1  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  31.25 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  28.4 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  30.13 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  30.46 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  32.48 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  28.42 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  31.25 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  29.59 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  25.27 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  28.78 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  32.14 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  28.18 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  31.98 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  30.21 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  30.28 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  30.23 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  30.81 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  32 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  31.19 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  38.61 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  29.03 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  32.41 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  31.62 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  30.34 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  33.33 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  30.6 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  38.38 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  29.08 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  33.57 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  29.41 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  30.89 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  31.94 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  30.06 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  29.45 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  31.72 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  30.5 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  28.93 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  28.49 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  31.16 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  28.57 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  29.28 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  29.79 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  29.08 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  28.48 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  31.18 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>