287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3579 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  78.05 
 
 		 193 aa  263  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  73.05 
 
 		 192 aa  249  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  71.6 
 
 		 194 aa  239  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  64.25 
 
 		 190 aa  238  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  67.68 
 
 		 190 aa  221  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  56.71 
 
 		 193 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  46.15 
 
 		 190 aa  158  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  44.44 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  48.47 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  45.45 
 
 		 190 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  46.24 
 
 		 189 aa  144  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  43.48 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  43.33 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  40.96 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  41.71 
 
 		 191 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  45.88 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  46.45 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  42.22 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  45.81 
 
 		 186 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  46.45 
 
 		 186 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  46.45 
 
 		 186 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  42.05 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  43.68 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  43.1 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  47.1 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  47.1 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  41.18 
 
 		 186 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  45.39 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  41.95 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  45.39 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  41.95 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  45.39 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  45.39 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  45.39 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  45.39 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  38.99 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  36.42 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  42.58 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  34.62 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  37.91 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  35.85 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  35.79 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  37.18 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  38.1 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  35.9 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  36.54 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  34.67 
 
 		 441 aa  98.2  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  36 
 
 		 420 aa  95.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  34.42 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  28.24 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  32.35 
 
 		 180 aa  84.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  29.45 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  31.28 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  28.92 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  29.8 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  34.97 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  33.33 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  33.92 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3331  YceI family protein  36.17 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.634515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.17 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  32.61 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  33.7 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  31.85 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  29.63 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.57 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  30.91 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  34.07 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  30.61 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  37.23 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  37.23 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  37.23 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  35.07 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  33.74 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  33.74 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  33.74 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  33.74 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  34.45 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  33.74 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  33.74 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  33.74 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  33.74 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  32.24 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  33.04 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  33.59 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  33.59 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  28.69 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  33.13 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  32.39 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  32.59 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  31.11 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  25.28 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  32.81 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  32.39 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  26.52 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  29.73 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  33.1 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  33.1 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  33.96 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  32.39 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>