More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2795 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2795  YceI  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  66.67 
 
 		 186 aa  228  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  51.85 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  48.3 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  44.86 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  45.9 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  46.45 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  46.01 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  50.98 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  50.98 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  50.33 
 
 		 196 aa  156  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  47.2 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  44.94 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  45.3 
 
 		 190 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  43.01 
 
 		 191 aa  151  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  48.7 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  46.79 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  46.58 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  46.58 
 
 		 186 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  46.58 
 
 		 186 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  39.44 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  42.08 
 
 		 190 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  46.41 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  46.41 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  41.14 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  44.1 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  49.69 
 
 		 186 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  49.69 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  49.69 
 
 		 186 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  49.69 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  49.69 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  47.2 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  37.57 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  49.06 
 
 		 207 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  47.71 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  46.58 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  46.58 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  41.67 
 
 		 189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  39.23 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  38.41 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  34.34 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  36.88 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  35.56 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  35.71 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  27.62 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  32.5 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  31.79 
 
 		 421 aa  91.3  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  31.82 
 
 		 191 aa  90.9  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  29.89 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  35 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  31.95 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  32.72 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  31.74 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  30.07 
 
 		 416 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  33.99 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  31.91 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  29.89 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  34.27 
 
 		 195 aa  84.7  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  34.5 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  29.3 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  31.29 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  30.06 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  31.3 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  31.01 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  29.05 
 
 		 420 aa  78.2  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  30.66 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  27.71 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  27.72 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  32.09 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  32.61 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  28.97 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  33.62 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  33.56 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  33.56 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  33.56 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  33.56 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  31.95 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  31.95 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  33.56 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  33.56 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  31.95 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  33.56 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  33.56 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.9 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  31.48 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  29.09 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  32.88 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  31.34 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  31.34 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  30.95 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  32.88 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  25.93 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  31.88 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  29.76 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  32.74 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  32.26 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  32.54 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  32.26 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>