More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4402 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  100 
 
 		 190 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  78.07 
 
 		 192 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  62.05 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  58.13 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  51.37 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  53.3 
 
 		 191 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  37.93 
 
 		 416 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  42.59 
 
 		 441 aa  117  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  39.55 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  37.7 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  36.81 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  45.4 
 
 		 421 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  36.52 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  38.99 
 
 		 420 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  36.54 
 
 		 194 aa  104  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  35 
 
 		 190 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  35.85 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  40.13 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  34.08 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  37.5 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  34.08 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  37.78 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  35.9 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  36.48 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  34.76 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  35.67 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  35.4 
 
 		 190 aa  99  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  34.68 
 
 		 183 aa  98.6  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  34.81 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  33.52 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  34.81 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  34.81 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  34.81 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  34.27 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  32.8 
 
 		 189 aa  94.7  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  32.8 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  32.58 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  38.31 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  32.6 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  37.43 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  36.31 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  36.31 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  36.08 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  33.33 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  36.08 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  34.87 
 
 		 182 aa  87.8  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  35 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  39.18 
 
 		 410 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  34.62 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  31.67 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  37.58 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  37.58 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  37.58 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  37.58 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  37.58 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  36.94 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  33.15 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  28.09 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  33.9 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  29.51 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  29.51 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  29.51 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  28.33 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  30.54 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  28.98 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  28.26 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  28.98 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  28.96 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  30.37 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  32.5 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  32.03 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  31.72 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  32.75 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  27.71 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  33.53 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  35.59 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  27.87 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  30.46 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  28.65 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  31.01 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  32.5 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  27.98 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  27.87 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  26.11 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  34.68 
 
 		 397 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  30.32 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  31.21 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  31.71 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  30.83 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  32.59 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  30.69 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  31.61 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  30.69 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  27.27 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  29.41 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  35.14 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  31.97 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  31.97 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  31.97 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  34.3 
 
 		 406 aa  64.7  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>