More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2817 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2817  YceI  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  80.53 
 
 		 191 aa  313  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  61.9 
 
 		 189 aa  224  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  56.84 
 
 		 190 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  57.89 
 
 		 190 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  57.14 
 
 		 186 aa  201  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  56.98 
 
 		 187 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  55.87 
 
 		 187 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  59.32 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  60.9 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  59.32 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  60.13 
 
 		 186 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  60.13 
 
 		 186 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  60.13 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  62.96 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  62.96 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  62.96 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  63.12 
 
 		 207 aa  191  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  51.11 
 
 		 191 aa  191  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  63.12 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  63.12 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  55.56 
 
 		 193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  50 
 
 		 191 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  60.13 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  59.49 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  52.29 
 
 		 192 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  50.93 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  50.65 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  48.85 
 
 		 190 aa  158  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  49.67 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  48.05 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  44.85 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  47.4 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  45.83 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  37.93 
 
 		 183 aa  141  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  41.51 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  39.74 
 
 		 186 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  37.36 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  35.87 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  37.33 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  35.98 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  36.51 
 
 		 192 aa  98.2  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  33.74 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  32.04 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  33.77 
 
 		 188 aa  94.7  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  28.4 
 
 		 191 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  31.49 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  30.86 
 
 		 191 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  32.39 
 
 		 421 aa  89.4  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  33.12 
 
 		 441 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  31.65 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  33.56 
 
 		 420 aa  87.8  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  31.21 
 
 		 416 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  36.84 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  36.21 
 
 		 178 aa  85.1  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  34.68 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  28.73 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  33.77 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30.99 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  27.43 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  33.57 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  27.27 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  28.03 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  29.19 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  32.79 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  37.76 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  37.76 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  31.62 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  32.54 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  31.43 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  29.59 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  29.08 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  30.15 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  31.06 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  31.97 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2233  YceI family protein  24.06 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466697  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  28.47 
 
 		 410 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  30.65 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  32.65 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  30.51 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  30.22 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  34.07 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  29.17 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  26.7 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  30.99 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  31.5 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  30.36 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  32.65 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  26.06 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  30.77 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  30.58 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  36.73 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  28.32 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  24.65 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  28.95 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  30.63 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  34.44 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  36.73 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>