282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2233 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2233  YceI family protein  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466697  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  31.76 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  29.73 
 
 		 183 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  28.5 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  27.08 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  28.76 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  27.85 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  24.06 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  33.33 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  27.5 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  28.5 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  26.84 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  27.98 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  29.68 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  27.98 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  27.91 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  27.98 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  27.98 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  27.91 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  27.98 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  29.17 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  28.75 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  34.35 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  26.38 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  28.19 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  25 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  29.76 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  29.76 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  29.76 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  24.5 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  27.72 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  26.99 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  28 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  27.17 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  30.37 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  28.48 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0172  hypothetical protein  36.57 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  29.29 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  27.45 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  31.74 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  25.6 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  24.1 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  25.62 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  27.1 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  31.16 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  27.44 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  25.29 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  29.46 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1848  YceI  26.53 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  28.97 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  28.03 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  31.33 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  29.46 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  24.7 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  29.22 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  29.41 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  30.4 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  30.4 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  28.74 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  25.12 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  30.51 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  29.58 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  33.07 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  29.58 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  29.58 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  26.99 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  29.58 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  27.94 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  29.58 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  29.58 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  29.58 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  30.07 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  26.83 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  27.74 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  28.03 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  27.5 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  28.03 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  28.26 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  26.87 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  28.03 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  32.52 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  28.57 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  30.41 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  24.1 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  25.77 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  28.35 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  23.81 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  26.63 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  25.77 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  31.47 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  27.22 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  28.18 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  28.26 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  28.18 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  26.63 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  28.18 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  28.18 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  26.04 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  27.44 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>