296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0172 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0172  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37090  hypothetical protein  39.6 
 
 		 172 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0651495  normal  0.0184068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  39.31 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  38.56 
 
 		 285 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  37.16 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  32.67 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  37.84 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  36.3 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  34.46 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  31.85 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  37.93 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  36.81 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  36.71 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  36.11 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  35.57 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  34.16 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  33.33 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  34.48 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  31.45 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  36.44 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  38.94 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  35.42 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  36.55 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  36.89 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  35.17 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  36.89 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  36.89 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  32.12 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  33.12 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  35.57 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  33.75 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  30.49 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  31.97 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  34.9 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  32.08 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  32.88 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  31.54 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  33.77 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  33.54 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4157  YceI family protein  37.5 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  32.64 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  35.03 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  31.87 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  34.72 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  30.43 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  31.87 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  32.08 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  34.15 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  32.88 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  32.64 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  37.75 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  32.65 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  30.63 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  34.19 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  29.33 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  32.7 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  29.45 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  35.57 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  34.48 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  34.48 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  35.57 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  34.48 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  31.13 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  34.21 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  30.82 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  33.33 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  36.05 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  40 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  29.03 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  29.94 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  38.3 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  33.33 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  35.71 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  30.56 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  29.03 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  30.52 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  35.29 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  30.09 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  38.3 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  25.16 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  28.45 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  30.97 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  30.56 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  32.48 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  39.39 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  29.41 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  39.39 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  29.11 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  40.2 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  39.39 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  33.33 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  28.45 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  28.45 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  28.45 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  34.95 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  28.45 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  31.85 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  28.45 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  28.45 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>