258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37090  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  340  5.999999999999999e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0651495  normal  0.0184068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0172  hypothetical protein  39.6 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  40 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  36.99 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  34.32 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  35.48 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  35.42 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  30.27 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  37.95 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  36.81 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  33.14 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  32.64 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  31.72 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  34.48 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  33.33 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  34.25 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  30.64 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  34.93 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  38.62 
 
 		 285 aa  68.2  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  33.33 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  32.08 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  33.8 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  36.81 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  36.11 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  34.03 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  36 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  34.03 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  34.03 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  36.11 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  31.98 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  36.42 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  30.34 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  31.37 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  38.46 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  29.17 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0326  YceI family protein  30 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  30.34 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  30.67 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  34.25 
 
 		 201 aa  63.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  34.93 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7356  YceI family protein  33.74 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  32.05 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  33.73 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  36.11 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2885  YceI family protein  30.22 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265419  normal  0.0897618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  38.46 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  30.52 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  29.17 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  31.36 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  30.46 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  32.06 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  29.86 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  31.25 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  33.78 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  32.45 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  34.72 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  32.45 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  37.6 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  29.33 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  34.25 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  30.46 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  31.97 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  28.07 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  29.17 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  27.27 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  32.41 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  26.57 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1515  YceI family protein  28.07 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.601487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  31.08 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3033  YceI family protein  30.11 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  36.52 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  30.92 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  30.56 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  32.69 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  30.82 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5437  YceI family protein  29.27 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  30.57 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  27.91 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4193  YceI family protein  36.75 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  29.75 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  29.75 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  29.94 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  30.54 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  28.78 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  30.91 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  30.54 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  26.71 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  31.29 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  31.25 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  25.75 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1848  YceI  27.38 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  27.5 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  30.33 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  32.74 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  26.71 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  26.71 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  26.71 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  26.71 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>