271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7356 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7356  YceI family protein  100 
 
 		 166 aa  337  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  35.71 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  34.5 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  35.12 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  34.44 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  33.14 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  30.51 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  33.52 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  33.77 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  32.73 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  33.11 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  33.11 
 
 		 201 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  33.11 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  34.42 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  29.89 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  29.3 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  31.4 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  30.52 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  29.68 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  31.14 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  33.11 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  28 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  30 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  32 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  31.33 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  30.29 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  31.4 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  36.49 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  29.07 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  28.65 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  32.54 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  33.14 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  27.67 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  31.79 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  32.24 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  31.55 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  30.77 
 
 		 193 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  31.33 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  31.58 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37090  hypothetical protein  33.74 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0651495  normal  0.0184068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  31.65 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  32.89 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  31.33 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  29.75 
 
 		 181 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  32.67 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  29.55 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  31.21 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  41.67 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  28.07 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  32.28 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  27.68 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  27.01 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  35.04 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  41.67 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  30.2 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  31.25 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  29.73 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  32.23 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  34.21 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  29.87 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  28.86 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  29.22 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  29.78 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  26.95 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  40.74 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  30.57 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  31.71 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  33.04 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  31.09 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  38.27 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  29.06 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  38.55 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  31.03 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  28.03 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  30.64 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  26.8 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  32.74 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  31.62 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  38.55 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  27.15 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  27.15 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0172  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  27.15 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  29.63 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  29.14 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  29.14 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  30.2 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  31.86 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  29.33 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  37.5 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  31.39 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  29.3 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  27.22 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  30.77 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  28.25 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  29.56 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  31.37 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  35.16 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  26.16 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  32.82 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>