289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4329 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  39.64 
 
 		 172 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  34.69 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  35.6 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  33.89 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  33.91 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  33.87 
 
 		 301 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  32.76 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  35.06 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  34.04 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  29.26 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  29.21 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  30.16 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  30.32 
 
 		 314 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  31.94 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  33.55 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  28.57 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  27.32 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  31.76 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.82 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  25.82 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  38.38 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  38.38 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  38.38 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  33.82 
 
 		 421 aa  65.5  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  26.88 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  28.65 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  28.41 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  29.93 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  29.93 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  36 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  32.73 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  31.69 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  27.03 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  34.34 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  31.47 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  31.29 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  31.45 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  41.89 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  29.71 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  35.51 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  32.33 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  42.47 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  30.95 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37090  hypothetical protein  30.56 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0651495  normal  0.0184068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  34.31 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  31.45 
 
 		 441 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  29.84 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  44.93 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  31.43 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  29.19 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  28.9 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  28.65 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  33.33 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  33.33 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  29.17 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  27.52 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7356  YceI family protein  29.06 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  31.09 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  29.51 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  30.95 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  27.59 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  33.7 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  40 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  29.55 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  29.14 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  27.52 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  27.39 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  34.48 
 
 		 397 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  27.89 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  34.34 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  31.58 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  31.15 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  27.92 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  33.33 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  34 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  28.35 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  30.08 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  29.03 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  30.48 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  26.8 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  29.27 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  29.03 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  30.21 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  36.49 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  36.49 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  36.49 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  30.21 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  32.2 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  36.49 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  36.49 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  36.49 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  29.03 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  29.03 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  29.45 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  36.49 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  29.03 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2233  YceI family protein  26.98 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466697  normal  0.0634125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>