99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4578 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  100 
 
 		 172 aa  347  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  56.82 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  46.2 
 
 		 219 aa  158  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  44.77 
 
 		 199 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  43.9 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  46.39 
 
 		 197 aa  147  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  46.15 
 
 		 188 aa  144  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  39.64 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  42.77 
 
 		 188 aa  124  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  34.46 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  34.27 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  35.67 
 
 		 202 aa  94.4  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  31.14 
 
 		 301 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  32.4 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  30.11 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  28.14 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  29.33 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  25.44 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  29.38 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  28.17 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  31.33 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  36.54 
 
 		 191 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  29.03 
 
 		 209 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  30.54 
 
 		 181 aa  51.2  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  32.79 
 
 		 178 aa  51.2  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  29.7 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  29.7 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  34.38 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  35 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  41.79 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  27.21 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2314  hypothetical protein  37.5 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.613001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  41.03 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  29.9 
 
 		 212 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  29.27 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  29.84 
 
 		 213 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  34.56 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  25 
 
 		 534 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  28.49 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  40.85 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  47.54 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  36.25 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  37.8 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  40.85 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  28.95 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  36.25 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  41.51 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  29.84 
 
 		 213 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  31.25 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  40.85 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  40.85 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5358  YceI family protein  29.85 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  32.41 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  41.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  41.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  41.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  36.73 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  40.74 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  41.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  45.45 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  41.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  41.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  41.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  41.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  25.47 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  42.62 
 
 		 237 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  42.62 
 
 		 237 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  35.16 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  23.78 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  32.77 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  32.41 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  27.54 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  25 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  36.59 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  44 
 
 		 191 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  38.46 
 
 		 181 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  37.1 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2359  YceI family protein  35.79 
 
 		 193 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  32.58 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  40.32 
 
 		 252 aa  41.6  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  37.14 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  28.7 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  42.86 
 
 		 201 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  25.66 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  32.08 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  31.58 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  24.64 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  30.93 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  40.98 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  31.43 
 
 		 180 aa  40.8  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  34.88 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  35.96 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  35.96 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  29.63 
 
 		 184 aa  40.8  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  36.54 
 
 		 193 aa  40.8  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  33.64 
 
 		 181 aa  40.8  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  40 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  33.94 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>