166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4888 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  52.49 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  53.03 
 
 		 202 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  49.73 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  48.5 
 
 		 197 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  46.15 
 
 		 172 aa  144  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  45.78 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  41.03 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  36.63 
 
 		 223 aa  113  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  35.6 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  38.1 
 
 		 164 aa  98.2  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  30.54 
 
 		 301 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  32.74 
 
 		 301 aa  95.5  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  36.26 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  29.89 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  34.68 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  31.28 
 
 		 220 aa  77.8  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  40.51 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  38.54 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  38.54 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  27.78 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  35.9 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  29.3 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  45 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  34.88 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  39.29 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  40.54 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  33.78 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  30.65 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  46.43 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  25.56 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  37.25 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  32.18 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  34.74 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  32.97 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  39.19 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  33.05 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  40.35 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  32.22 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  36.36 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  34.23 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  38.2 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  27.87 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  38.2 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  34.4 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  53.7 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  53.7 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  39.08 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  32.52 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  31.05 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  41.67 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  35.16 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  39.29 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  35.16 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  31.82 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  43.64 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  30.37 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  27.91 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  28.11 
 
 		 534 aa  47.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  47.37 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  36.99 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2359  YceI family protein  29.46 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  46.55 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  30.97 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  39.34 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  37.84 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  37.33 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  34.43 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  34.88 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  38.6 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  29.81 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  37.5 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  37.29 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  26.03 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  31.4 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  29.63 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  33.33 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  45.76 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  32.35 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  30.6 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  32.93 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  29.53 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  29.67 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  35.59 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  35.59 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  35.59 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  27.59 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  25 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  29.08 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  43.55 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  32.04 
 
 		 175 aa  45.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  29.89 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  28.74 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  38.33 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  35.71 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  29.2 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  39.44 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  25.95 
 
 		 187 aa  44.7  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  33.33 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  27.61 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>