68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06410 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  100 
 
 		 188 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  52.49 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  50 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  47.27 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  44.44 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  43.37 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  42.77 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  41.21 
 
 		 223 aa  117  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  34.04 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  34.5 
 
 		 301 aa  94.4  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  36.69 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  32.52 
 
 		 301 aa  88.6  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  31.95 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  29.65 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  33.33 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  34.36 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  31.64 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  29.76 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  35.23 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  28.57 
 
 		 534 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  42.39 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  35.35 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  30 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  31.65 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  35.19 
 
 		 420 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  39.33 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  39.33 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  43.66 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  33.72 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  35.05 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  29.93 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  31.3 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30.77 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  30.56 
 
 		 441 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  31.3 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  32.09 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  32.43 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  33.93 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  34.09 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  31.11 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  43.06 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  34.26 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  30.91 
 
 		 209 aa  44.7  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  29.07 
 
 		 188 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  33.93 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  30.25 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  30.53 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  40.82 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  40.82 
 
 		 181 aa  42  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  31 
 
 		 181 aa  42  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  25.38 
 
 		 175 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  38.46 
 
 		 183 aa  42  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  32.69 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  28.18 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  30.77 
 
 		 189 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  31.46 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  26.04 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  26.04 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  26.04 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  31.11 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  43.48 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  29.56 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  37.93 
 
 		 199 aa  41.2  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  43.4 
 
 		 175 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  37.04 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  33.87 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>