49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1930 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  35.29 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  35.67 
 
 		 172 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  32.02 
 
 		 219 aa  87.8  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  29.21 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  36.26 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  34.66 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  32.77 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  34.36 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  29.06 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  26.88 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  26.01 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  29.35 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  32.12 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  28.65 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  25.71 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  29.07 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  28.32 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  28.65 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  25.86 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  29.38 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  27.49 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  27.42 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  31 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  29.73 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  33.33 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  30.3 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  30.39 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  31.17 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2314  hypothetical protein  29.7 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.613001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  29.82 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  29.7 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  28.88 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  26.52 
 
 		 314 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  28.75 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  27.78 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  33.66 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  29.41 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  24 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  22.3 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  34.09 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  30.1 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  30.1 
 
 		 182 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  29.41 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  35.06 
 
 		 179 aa  41.6  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  28.87 
 
 		 180 aa  41.6  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  29.63 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>