42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08246 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  100 
 
 		 223 aa  455  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  39.89 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  40.11 
 
 		 199 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  38.16 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  41.21 
 
 		 188 aa  118  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  37.64 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  36.63 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  33.77 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  34.46 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  34.93 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  32 
 
 		 184 aa  93.2  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  29.26 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  28.64 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  27.75 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  32.95 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  29.67 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  28.9 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  29.19 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  28.79 
 
 		 534 aa  62  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  31.82 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  33.05 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  32.35 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  31.06 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  31.06 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  28.76 
 
 		 177 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  22.55 
 
 		 416 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  31.06 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  27.61 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  29.23 
 
 		 441 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  39.68 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  28.4 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  35.29 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7356  YceI family protein  31.13 
 
 		 166 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  37.65 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  22.58 
 
 		 188 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  31.65 
 
 		 187 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  25.9 
 
 		 410 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  26.76 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  29.25 
 
 		 192 aa  41.6  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  27.87 
 
 		 199 aa  41.6  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>