239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4376 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  50.51 
 
 		 301 aa  301  9e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  35.15 
 
 		 314 aa  188  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  34.46 
 
 		 202 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  34.17 
 
 		 219 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  29.41 
 
 		 199 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  33.33 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  30.54 
 
 		 188 aa  95.9  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  28.65 
 
 		 197 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  31.35 
 
 		 220 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  34.19 
 
 		 212 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  31.14 
 
 		 172 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  29.14 
 
 		 184 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  32.52 
 
 		 188 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  31.17 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  30.16 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  30.82 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  29.76 
 
 		 190 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  25.95 
 
 		 534 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  26.67 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  40.37 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  40.37 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  40.37 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  40.37 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  27.12 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  26.59 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  25.71 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  25.71 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 122 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  39.81 
 
 		 528 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  35.09 
 
 		 774 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  26.62 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  27.07 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  32.17 
 
 		 530 aa  52.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.89 
 
 		 393 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  26.75 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  40.62 
 
 		 535 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 		 142 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  37.5 
 
 		 229 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  30.09 
 
 		 112 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  24.57 
 
 		 186 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  24.57 
 
 		 186 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.13 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  36 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  31.53 
 
 		 112 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 		 154 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.62 
 
 		 130 aa  49.7  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  30.25 
 
 		 140 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 		 121 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  35.58 
 
 		 209 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  35.11 
 
 		 527 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  36.61 
 
 		 197 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 569 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 		 523 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 112 aa  49.3  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.11 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  28.15 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  22.86 
 
 		 186 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  30.43 
 
 		 170 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  31.43 
 
 		 119 aa  49.3  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 140 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  31.43 
 
 		 198 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  24.57 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  29.91 
 
 		 184 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  29.41 
 
 		 140 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 140 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  26.11 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  40.22 
 
 		 527 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 189 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  39.82 
 
 		 116 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  35.11 
 
 		 569 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  30.08 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 189 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 		 411 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  25.14 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  36.84 
 
 		 532 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 135 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  25.71 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0892  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 		 125 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.94 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  24.43 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.23 
 
 		 480 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  29.58 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0795  rhodanese-like domain-containing protein  31 
 
 		 102 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  29.7 
 
 		 123 aa  47.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1579  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  29.9 
 
 		 566 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.9 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  35.8 
 
 		 180 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 541 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 		 739 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.13 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>