70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0371 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  44.68 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  32.87 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  34.19 
 
 		 301 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  32.9 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  31.29 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  27.75 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  28.32 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  27.54 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  28.28 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  28.57 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  26.09 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  26.11 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  26.85 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  28.91 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  27.85 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  24.68 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  27.43 
 
 		 164 aa  52  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  31.58 
 
 		 175 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  30.28 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  26.95 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  27.03 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  24.81 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  32.38 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  31.4 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  34.91 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  35.87 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  25 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  27.22 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  26.98 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  24.05 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  28.35 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  28.97 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3033  YceI family protein  30.3 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  25 
 
 		 192 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  22.78 
 
 		 421 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  26.53 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  26.53 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  30.84 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  31.21 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  26.53 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  31.21 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  33 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  33.65 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  32.46 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  34.69 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  29.41 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  26.72 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  27.89 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  27.84 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  41.67 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  30.23 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  28.47 
 
 		 183 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  33.67 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  32.26 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  32.99 
 
 		 223 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  26.7 
 
 		 187 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  37.5 
 
 		 189 aa  41.6  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  28.57 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>