201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3177 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  100 
 
 		 199 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  60.59 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  53.27 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  49.73 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  44.77 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  45.68 
 
 		 184 aa  147  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  48.26 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  47.27 
 
 		 188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  39.89 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  30.96 
 
 		 301 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  33.91 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 301 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  32.29 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  34.81 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  27.72 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  32.77 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  31.55 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  31.29 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  31.94 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  25.34 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  37.5 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  36.78 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  35.37 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  34.69 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  36.36 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  36.36 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  36.36 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  39.08 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  35.29 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  31.58 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  34.09 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  34.35 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  35.35 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  32.35 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  35.63 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  50 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  28.47 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  34.52 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  28.06 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  29.17 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  37.68 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  50 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  31.25 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  36.78 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  32.35 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  32.35 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  39.29 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  29.2 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  32.23 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  40 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  32.11 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  34.15 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  41.18 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  34 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  29.56 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5358  YceI family protein  30.28 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  29.05 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  35.9 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  30.77 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  31.73 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  24.12 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  47.83 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  25 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  38.57 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  47.46 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  50 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  38.57 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  37.14 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  37.14 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3378  YceI, base-induced periplasmic protein  40 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  30.54 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  28.49 
 
 		 534 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  31.73 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  41.38 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0296  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1158  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  28.57 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  35.23 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  34.09 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  40 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  26.97 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3335  YceI  40 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3369  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  35.16 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  25.53 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  36.49 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7356  YceI family protein  26.47 
 
 		 166 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  28.57 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  42 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  28.05 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  27.27 
 
 		 420 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  28.67 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  27.85 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  33.78 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  28.86 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  28.86 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  29.8 
 
 		 182 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>