206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3680 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  50.56 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  46.31 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  44.56 
 
 		 188 aa  150  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  46.39 
 
 		 172 aa  148  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  48.26 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  38.42 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  43.37 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  37.64 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  33.89 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  32.61 
 
 		 301 aa  101  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  28.65 
 
 		 301 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  35.14 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  34.66 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  33.33 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  28.57 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  29.41 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  30.49 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  31.46 
 
 		 534 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  29.59 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  26.88 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  28.57 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  35.58 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  35.58 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  51.85 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  24.71 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  26.62 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  27.01 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  44.62 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  25.6 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  27.16 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  28.7 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  25.85 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  40 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  32.26 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5358  YceI family protein  28.38 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  28.12 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  25.29 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  32.23 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  36.76 
 
 		 177 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  33.33 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  25.6 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  40.86 
 
 		 171 aa  51.6  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  40.86 
 
 		 171 aa  51.6  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  30.48 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  31.9 
 
 		 183 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  37.63 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  26.5 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  29.28 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  26.63 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  26.63 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  26.19 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  27.83 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  24.4 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  26.58 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  31.91 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  30.36 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  25.7 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  27.78 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  30.34 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  27.34 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  26.8 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  32.56 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  29.63 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  26.63 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  40 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  31.4 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  27.34 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  42.31 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  32.06 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  34.26 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  27.59 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  34.26 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  31.31 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  36.26 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  31.19 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  23.86 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  27.37 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  48.08 
 
 		 254 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  34.91 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  35.29 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  30.32 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  29.94 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  40 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  27.15 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  23.3 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  26.04 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  30.93 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  36.76 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  30.11 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  26.57 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  26.38 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  26.57 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  27.34 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  27.84 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  25.6 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  26.45 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  26.57 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  26.57 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>