90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3996 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  362  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  56.82 
 
 		 172 aa  202  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  44.44 
 
 		 219 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  42.94 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  45.68 
 
 		 199 aa  147  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  38.42 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  41.03 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  40 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  29.48 
 
 		 301 aa  104  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  35.06 
 
 		 200 aa  101  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  26.82 
 
 		 314 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  32 
 
 		 223 aa  93.2  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  31.64 
 
 		 220 aa  91.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  29.14 
 
 		 301 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  31.33 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  28.92 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  26.01 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  28.04 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  26.45 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  27.07 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  24 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  29.69 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  28.07 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  28.74 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  31.15 
 
 		 175 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  28.07 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  40.35 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  29.27 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  31.86 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  27.56 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  29.57 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  30.7 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  25.55 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  25.56 
 
 		 534 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  27.08 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  34.02 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  27.56 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1264  YceI family protein  36 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  36.76 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  34.04 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  38.1 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  31.46 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  28.7 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  24.29 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  33.94 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  23.78 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  25.96 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  34.07 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  32 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  29.1 
 
 		 201 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  29.55 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  29.82 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  29.55 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  28.72 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  31.87 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  33.7 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  27.78 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  38.46 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  23.85 
 
 		 199 aa  44.7  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  28.41 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  28.41 
 
 		 192 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  28.35 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  32.89 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  34.21 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  23.43 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  26.16 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  36.9 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  28.03 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3115  YceI family protein  27.84 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0561184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  31.71 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  34.88 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  36.26 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  29.85 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  35.71 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  26.77 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  30.84 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  24.5 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  40.35 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  32.82 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  34.88 
 
 		 199 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  36.73 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  26 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  25.33 
 
 		 182 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  35.38 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  27.03 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  38.46 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  27.78 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  26.79 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  26.19 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  36.36 
 
 		 177 aa  40.8  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>