270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1264 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1264  YceI family protein  100 
 
 
173 aa  347  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  36.47 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  40.12 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  36.9 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  35.09 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  39.41 
 
 
176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  33.73 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  36.42 
 
 
177 aa  108  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  35.67 
 
 
174 aa  104  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  31.76 
 
 
182 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  31.14 
 
 
204 aa  101  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  33.53 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  36.2 
 
 
183 aa  98.2  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  33.53 
 
 
175 aa  98.2  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  30.77 
 
 
183 aa  97.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  33.33 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  30.77 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  30.18 
 
 
183 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  32.37 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  31.95 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  31.95 
 
 
201 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  32.56 
 
 
181 aa  94  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  30.77 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  31.55 
 
 
201 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  31.98 
 
 
209 aa  92.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  31.36 
 
 
223 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  32.93 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  28.07 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  31.18 
 
 
186 aa  92  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  32.16 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  30.77 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  29.24 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  28.65 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  33.53 
 
 
212 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  31.98 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  34.36 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  29.59 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  28.9 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  29.59 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  29.59 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  32.16 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  28.07 
 
 
182 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  30.59 
 
 
195 aa  88.2  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  28.99 
 
 
179 aa  87.8  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  30.51 
 
 
187 aa  87.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  30.67 
 
 
183 aa  87.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  33.14 
 
 
193 aa  87  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  31.58 
 
 
196 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  28.07 
 
 
201 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  29.24 
 
 
200 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  30.59 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  31.76 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  30.95 
 
 
183 aa  85.5  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  32 
 
 
181 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  27.17 
 
 
201 aa  85.5  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  31.76 
 
 
184 aa  85.1  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  31.29 
 
 
187 aa  84.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  30.77 
 
 
185 aa  84.3  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  31.9 
 
 
182 aa  84.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  26.09 
 
 
202 aa  84  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  30.81 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  29.03 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  31.13 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  29.88 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  30.67 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  32.32 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  30.43 
 
 
178 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  29.88 
 
 
201 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  33.12 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  29.48 
 
 
197 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  30.56 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  31.9 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  25.43 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  29.34 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  30.6 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  28.07 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  30.23 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  28.4 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  31.71 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  31.18 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  29.76 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  31.61 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  27.78 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  27.49 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  30.61 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  26.79 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  28.99 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  28.66 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  26.79 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  25 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  25.73 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  31.25 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  31.25 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  32.18 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  28.4 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  27.16 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  29.17 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  25.15 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2314  hypothetical protein  28.9 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.613001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  27.44 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>