268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4649 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  36.31 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  32.65 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  30.46 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  34.33 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  29.86 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  33.33 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  33.55 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  37.4 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  34.21 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  34.21 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  34.21 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  36.64 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  35.88 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  35.24 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  29.53 
 
 		 420 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  33.6 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  31.85 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  29.5 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  24.81 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  34.09 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  35.59 
 
 		 410 aa  65.1  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  30.88 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  29.41 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  33.57 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  29.29 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  30.95 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  27.17 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  32.06 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  33.85 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  30.19 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  34.81 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  34.81 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  29.36 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  33.33 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  32.06 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  26.23 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  33.82 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  31.19 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  31.82 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  35.63 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  35.63 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  35.63 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  33.64 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  39.08 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  27.27 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  32.86 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  36.78 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  30.53 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  31.3 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  31.16 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  35.63 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  37.93 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  36.78 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  28.49 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  29.71 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  36.54 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  30 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  35.48 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  31.54 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  27.56 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  33.8 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  30.71 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  30.65 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  26.43 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  28.4 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  33.33 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  31.75 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  27.56 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  26.43 
 
 		 441 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  32.28 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  24.65 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  31.68 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  26.19 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  28 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  31.25 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  28.89 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  28.43 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  25 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  32.38 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  31.34 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  32.38 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  32.38 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  27.1 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  35.63 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  25.35 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  29.07 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  35.63 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>