262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3115 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3115  YceI family protein  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0561184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2273  YceI family protein  59.24 
 
 
191 aa  214  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.322488  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  32.75 
 
 
237 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  32.16 
 
 
237 aa  88.6  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  29.32 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  29.47 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  29.63 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  29.63 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  29.7 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  31.14 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  26.67 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  27.22 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  30 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  29.09 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  28.75 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  29.76 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  32.39 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  31.69 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  28.49 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  22.35 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  25.97 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  26.98 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  24.4 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3331  YceI family protein  28.66 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.634515  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  30.28 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  27.89 
 
 
192 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  24.24 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  28.73 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  25.77 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  29.58 
 
 
192 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  25.93 
 
 
199 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  29.58 
 
 
192 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  24.4 
 
 
191 aa  62  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  29.58 
 
 
192 aa  62  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  25 
 
 
213 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  26.32 
 
 
196 aa  61.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  26.55 
 
 
201 aa  61.2  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  25.38 
 
 
189 aa  61.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  25.44 
 
 
213 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  28.91 
 
 
176 aa  60.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  25.44 
 
 
213 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  30.22 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  25.3 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  25.44 
 
 
206 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  27.11 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  25 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2827  hypothetical protein  29.67 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal  0.637752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  26.9 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  22.95 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  23.78 
 
 
209 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  26.9 
 
 
201 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  26.9 
 
 
178 aa  57.8  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  27.74 
 
 
214 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  25 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  28.06 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  25.87 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  22.65 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  29.58 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  28.06 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  28.99 
 
 
192 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  28.37 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  28.37 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  28.37 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  28.37 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  28.37 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  29.25 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  28.37 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  31.3 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  34.38 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  28.37 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  28.37 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  26.54 
 
 
213 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  28.97 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  28.37 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  28.37 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  28.37 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  25.69 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  30.89 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  28.37 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  28.57 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  27.66 
 
 
191 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  27.32 
 
 
216 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  26.92 
 
 
190 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  28.06 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  27.66 
 
 
191 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  28.57 
 
 
187 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  28.57 
 
 
187 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  30.25 
 
 
219 aa  54.7  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  28.57 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  26.83 
 
 
198 aa  54.3  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  28.57 
 
 
192 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  24.39 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  28.48 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  25.63 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  27.41 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  25.83 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  28.69 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>