176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2827 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2827  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  362  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal  0.637752 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  35 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1385  YceI like family protein  29.44 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00309571  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  34.51 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  34.51 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  35 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  34.51 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  34.51 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  34.51 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  34.51 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  35.38 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  33.8 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  37.8 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  32.75 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  33.09 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  28.65 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  34.13 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3115  YceI family protein  30.3 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0561184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  34.23 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  41.77 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  30.06 
 
 		 252 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  27.61 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  27.61 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  28.14 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  27.61 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1185  YceI like family protein  34.19 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0144  hypothetical protein  34.19 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0826223  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0423  YceI like family protein  34.19 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.31148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1156  hypothetical protein  34.19 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  29.17 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  29.17 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  33.33 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1502  YceI like family protein  34.19 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263508  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1415  hypothetical protein  34.19 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  40.51 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2273  YceI family protein  26.59 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.322488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  26.63 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  30.77 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  29.89 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  32.48 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0016  YceI-like family protein  33.33 
 
 		 328 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  27.54 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  39.24 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  27.54 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  26.36 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  32.84 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  27.54 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  31.78 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  27.27 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  32.17 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  26.03 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0172  hypothetical protein  34.06 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  25.58 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  25.58 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  25.58 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  25.58 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  25.58 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  25.58 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  25.58 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  25.58 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  28.36 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  30.17 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  29.37 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  27.52 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  36.49 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  27.78 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  24.81 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  35.37 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  31.25 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  33.56 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  27.22 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  28.46 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0293  hypothetical protein  30.23 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  27.52 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  26.06 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  25.49 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  24.29 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3331  YceI family protein  30.5 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.634515  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  22.62 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  32.41 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  30.89 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  28.78 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  28.23 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  26.02 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  27.14 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  27.07 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  37.5 
 
 		 285 aa  47.8  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  24.81 
 
 		 192 aa  47.8  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37090  hypothetical protein  31.65 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0651495  normal  0.0184068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1264  YceI family protein  23.14 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  32.93 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  34.15 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  27.61 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>