274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2273 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2273  YceI family protein  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.322488  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3115  YceI family protein  60.92 
 
 		 183 aa  211  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0561184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  28.42 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  30.59 
 
 		 237 aa  84.7  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  84.7  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  28.72 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  28.96 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  28.96 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  28.3 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  32.03 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  31.3 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  31.33 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  30.95 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  27.65 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  28.26 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  28.4 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  28.57 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  27.81 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  34.04 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  26.88 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  32.86 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  28.57 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  27.61 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  28.8 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  26.42 
 
 		 213 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  32.19 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  29.51 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  29.52 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  30.43 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  29.14 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  29.14 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  23.81 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  28.04 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  30.83 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  30.82 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  25.16 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  29.2 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  29.93 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  25.33 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  31.87 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  26.15 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  32.37 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  29.93 
 
 		 213 aa  62  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  29.2 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3331  YceI family protein  28.95 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.634515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  30.94 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  30.56 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  26.06 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  28.86 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  34.35 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  29.76 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  30 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  27.59 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  25.69 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  29.84 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  28.57 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  30.77 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  27.34 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  30.22 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  30.08 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  27.94 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  24.7 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  27.21 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  29.63 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  27.14 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  24.49 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  24.83 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  26.81 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  31.13 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  25.52 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  29.13 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  24.83 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  22.4 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  24.83 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  27.01 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  27.83 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  26.81 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2359  YceI family protein  24.61 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  27.51 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  29.23 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  31.34 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  23.12 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  28.47 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2827  hypothetical protein  26.59 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal  0.637752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  27.52 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  27.83 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  25.13 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  30.77 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  26.99 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  24.03 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2531  YceI family protein  25.85 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  24.03 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  24.03 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  36.79 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  24.66 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  23.24 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  24.03 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  24.66 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>