More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3331 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3331  YceI family protein  100 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.634515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  38 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  32.57 
 
 		 199 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  32.92 
 
 		 213 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  32.64 
 
 		 175 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  37.68 
 
 		 191 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  32.7 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  36.02 
 
 		 186 aa  90.1  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  35.71 
 
 		 192 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.03 
 
 		 177 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  31.76 
 
 		 182 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  31.38 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  32.16 
 
 		 204 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  32.74 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  36.48 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  30.25 
 
 		 206 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  27.72 
 
 		 189 aa  85.5  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  33.94 
 
 		 191 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  33.94 
 
 		 191 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  33.94 
 
 		 191 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  30.81 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  31.15 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  30.05 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  31.15 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  31.15 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  31.15 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  31.15 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  31.15 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  32.98 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  31.15 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  31.15 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  29.21 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  31.15 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  36.55 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  33.33 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  32.16 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  30.6 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  32.16 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  30.6 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  29.34 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  32.08 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  33.94 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  30.6 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  33.1 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  33.53 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  30.91 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  33.53 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  33.93 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  33.53 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  33.13 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  32 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  36.42 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  29.76 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  29.76 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  38.03 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  34.52 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  29.83 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  33.73 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  31.33 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  35.51 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  34.07 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  34.07 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  29.35 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  33.09 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  28.73 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  29.66 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  33.05 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  31.93 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  30 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  29.76 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  29.51 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  33.57 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  33.57 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  34.83 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  29.63 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  34.75 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  29.09 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  31.33 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  34.67 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  30.72 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  32.67 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  32.89 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  26.14 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  31.18 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  29.45 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  32.86 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  32.24 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  29.76 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  32.24 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  32.24 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  31.93 
 
 		 189 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  34.72 
 
 		 181 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  30.34 
 
 		 175 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  31.93 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  28.16 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  28.22 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>