63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10138 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  100 
 
 		 164 aa  334  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  38.1 
 
 		 188 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  36.69 
 
 		 188 aa  90.1  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  31.17 
 
 		 301 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  34.21 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  31.94 
 
 		 200 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  32.88 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  34.08 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  32.95 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  30.73 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  31.94 
 
 		 199 aa  70.5  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  29.41 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  28.14 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  28.92 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  28.38 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  28.9 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  27.59 
 
 		 534 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  27.43 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  29.52 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  29.37 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  30.39 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  28.07 
 
 		 189 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  27.82 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  31.13 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  44.78 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  26.21 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  38.98 
 
 		 209 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  25.16 
 
 		 314 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  28.68 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  40.68 
 
 		 213 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  26.71 
 
 		 186 aa  43.9  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  28.45 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  24.18 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  30.77 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  32.63 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  27.1 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  28.95 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  40 
 
 		 189 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  30.19 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  29.91 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  31.13 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  26.67 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7356  YceI family protein  26 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  34.65 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  28.57 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  28 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  38.98 
 
 		 213 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  28.79 
 
 		 181 aa  41.2  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  27.66 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  27.66 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  22.86 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  32.08 
 
 		 201 aa  41.2  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  25 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  27.66 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  27.18 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  37.21 
 
 		 204 aa  41.2  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  31.52 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  28.3 
 
 		 182 aa  40.8  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  31.52 
 
 		 188 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  31.52 
 
 		 188 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  35.82 
 
 		 237 aa  40.8  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  35.82 
 
 		 237 aa  40.8  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  31.67 
 
 		 183 aa  40.4  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>