107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2792 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  100 
 
 		 314 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  43.34 
 
 		 301 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  35.15 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  26.82 
 
 		 184 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  31.95 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  29.89 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  27.72 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  28 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  30.32 
 
 		 200 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  28.64 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  32.4 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  27.27 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  28.57 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  25 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  26.14 
 
 		 194 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  32.65 
 
 		 112 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 		 104 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  25.32 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  24.84 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2519  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 244 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4649  rhodanese domain-containing protein  28.83 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  33.02 
 
 		 140 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  32 
 
 		 116 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  28.7 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 102 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 140 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  27.83 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 140 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 140 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  32.08 
 
 		 140 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 140 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  34.41 
 
 		 170 aa  49.3  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 143 aa  49.3  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.43 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  29.63 
 
 		 137 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  30.69 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 		 141 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 140 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 		 154 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  29.81 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 		 144 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  29.22 
 
 		 191 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 		 124 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.72 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  35.09 
 
 		 535 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.46 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  31.73 
 
 		 137 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 		 549 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  38.68 
 
 		 129 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 		 549 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  30.43 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 138 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  30.63 
 
 		 148 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 106 aa  46.2  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 135 aa  46.2  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.96 
 
 		 104 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  26.52 
 
 		 202 aa  45.8  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  33.65 
 
 		 126 aa  45.8  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  47.92 
 
 		 569 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 151 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  38.96 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  38.96 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  37.63 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  27.93 
 
 		 148 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  25.16 
 
 		 164 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  24.27 
 
 		 670 aa  44.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.96 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.96 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.96 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.96 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.96 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 		 146 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  37.63 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  38.96 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  37.86 
 
 		 129 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.71 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  28.7 
 
 		 144 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  45.83 
 
 		 568 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 		 555 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 		 568 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 		 541 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  26.95 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  28.85 
 
 		 151 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  31.73 
 
 		 135 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  29.59 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 		 172 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  28.04 
 
 		 140 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  27.91 
 
 		 122 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 278 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  27.03 
 
 		 141 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 		 569 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 171 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  43.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  33.06 
 
 		 665 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 		 533 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  32.46 
 
 		 143 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>