137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0349 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  294  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  70.42 
 
 		 143 aa  205  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  67.61 
 
 		 152 aa  200  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  66.2 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  66.17 
 
 		 142 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  64.34 
 
 		 151 aa  190  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  64.08 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  64.66 
 
 		 146 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  58.57 
 
 		 147 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  60.43 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  60.9 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  62.9 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  64.17 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  62.1 
 
 		 147 aa  170  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  47.52 
 
 		 689 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  45.19 
 
 		 688 aa  91.3  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  38.38 
 
 		 670 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2035  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  34.78 
 
 		 247 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.65 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  33.71 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  30.26 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  30.6 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  31.73 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  31.25 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  35.23 
 
 		 363 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  25.64 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  26.32 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  26.32 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  27.72 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  31.54 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  32.94 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  24.79 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 377 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  32 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  35.05 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  28.16 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  32.58 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  32.58 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0755  Rhodanese domain protein  30.67 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  32.73 
 
 		 454 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.46 
 
 		 389 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  36.59 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.53 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.56 
 
 		 388 aa  47  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  31.11 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  26.5 
 
 		 353 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  33.85 
 
 		 406 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  28.16 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  33.03 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  35.4 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  24.27 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  27.55 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  31.54 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  23.36 
 
 		 252 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  30 
 
 		 401 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  30.85 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  30.93 
 
 		 553 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.61 
 
 		 1240 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  25.53 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 480 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  27.37 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  31.37 
 
 		 685 aa  44.7  0.0005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  28.03 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  29.17 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  30.69 
 
 		 432 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  27.12 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1961  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 		 244 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  23.58 
 
 		 185 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  27.36 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  28.74 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  27.36 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  30 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  32.97 
 
 		 334 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  28.28 
 
 		 258 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  24.53 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  27.03 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  26.67 
 
 		 171 aa  42.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  26.96 
 
 		 380 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  29.91 
 
 		 455 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  27.83 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4199  rhodanese-like protein  28.43 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4426  rhodanese domain-containing protein  28.43 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338924  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  25.78 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  26.44 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2215  rhodanese-like protein  36.67 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.636017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>