122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0494 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  298  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  83.1 
 
 		 143 aa  248  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  79.58 
 
 		 152 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  78.87 
 
 		 151 aa  240  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  72.54 
 
 		 142 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  71.83 
 
 		 142 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  66.2 
 
 		 146 aa  218  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  65.49 
 
 		 146 aa  214  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  66.2 
 
 		 146 aa  213  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  64.08 
 
 		 147 aa  207  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  74.17 
 
 		 147 aa  206  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  74.17 
 
 		 147 aa  205  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  73.33 
 
 		 147 aa  204  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  69.42 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  33.8 
 
 		 689 aa  83.6  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  32.84 
 
 		 688 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  34.65 
 
 		 670 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2035  rhodanese domain-containing protein  28.71 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  33.68 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  36.23 
 
 		 377 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  29.59 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  32.58 
 
 		 363 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  30.51 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  28.18 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  25.49 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2215  rhodanese-like protein  36.67 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.636017  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  27.97 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.74 
 
 		 389 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  28.03 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.03 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2303  rhodanese-like protein  33.82 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.788958  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  31.17 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 		 454 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  32.88 
 
 		 406 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.89 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  28.68 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  34.15 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  36.71 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  23.7 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  32.11 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  35.37 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  23.53 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  27.71 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  27.34 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  26.44 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  36.23 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  31 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  29.21 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  29.69 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  32.53 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  29.21 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0755  Rhodanese domain protein  32.88 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  32.18 
 
 		 173 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  29.59 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 247 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  30.85 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  25.47 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  25.47 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 224 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  30 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  29.17 
 
 		 553 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  27.88 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  32.53 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 		 102 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  32.63 
 
 		 141 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  27.03 
 
 		 116 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 		 129 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  32.39 
 
 		 432 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  27.66 
 
 		 254 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  34.12 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  25.4 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  28.97 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  26.45 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>