71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0014 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  51.76 
 
 
688 aa  717    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  58.26 
 
 
689 aa  811    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  100 
 
 
670 aa  1395    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  41.77 
 
 
729 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  38.16 
 
 
618 aa  389  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  36.7 
 
 
615 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  40.59 
 
 
616 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  36.41 
 
 
619 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  40.2 
 
 
616 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  37.62 
 
 
688 aa  363  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  37.63 
 
 
618 aa  362  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  34.82 
 
 
662 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  36.74 
 
 
655 aa  313  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  28.35 
 
 
566 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  28.35 
 
 
571 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  28.35 
 
 
566 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  27.97 
 
 
577 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  27.5 
 
 
658 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  28.07 
 
 
757 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  36.12 
 
 
236 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  33.49 
 
 
241 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  33.49 
 
 
241 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  33.49 
 
 
241 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  34.08 
 
 
247 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  31.09 
 
 
211 aa  87.8  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1338  cytochrome c family protein  54.93 
 
 
75 aa  81.3  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.207335  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  28.64 
 
 
346 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  28.64 
 
 
346 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  28.51 
 
 
346 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  28.64 
 
 
346 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  27.98 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 
146 aa  61.6  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 
146 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  32.56 
 
 
146 aa  61.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 
147 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  38.38 
 
 
141 aa  61.2  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 
147 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 
147 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 
147 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  34.65 
 
 
142 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
142 aa  55.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  28.57 
 
 
189 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  31.62 
 
 
883 aa  53.5  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 
151 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 
142 aa  51.6  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  26.67 
 
 
173 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  26.46 
 
 
211 aa  50.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 
125 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
152 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  26.99 
 
 
189 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 
143 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  31.48 
 
 
553 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  32.08 
 
 
109 aa  48.5  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  33.04 
 
 
144 aa  47  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  33.33 
 
 
427 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  25.98 
 
 
252 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  27.18 
 
 
170 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  32.79 
 
 
148 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  30.28 
 
 
270 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  26.4 
 
 
129 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30.69 
 
 
142 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  35.24 
 
 
270 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  26.9 
 
 
148 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  28.45 
 
 
130 aa  45.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  27.61 
 
 
188 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  26.72 
 
 
129 aa  45.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.22 
 
 
227 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  24.27 
 
 
314 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  31.96 
 
 
127 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  31.96 
 
 
220 aa  43.9  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  32.32 
 
 
270 aa  43.9  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>