70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2063 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  66.5 
 
 		 619 aa  833    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  65.74 
 
 		 618 aa  849    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1281    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  62.8 
 
 		 616 aa  803    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  66.17 
 
 		 618 aa  807    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  61.6 
 
 		 616 aa  794    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  36.7 
 
 		 670 aa  376  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  36.08 
 
 		 688 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  35.74 
 
 		 689 aa  372  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  34.41 
 
 		 662 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  37.72 
 
 		 688 aa  361  3e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  34.44 
 
 		 729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 655 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  28.42 
 
 		 757 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  30.21 
 
 		 566 aa  220  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  29.69 
 
 		 566 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  30.16 
 
 		 571 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  27.88 
 
 		 658 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  29.4 
 
 		 577 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  34.05 
 
 		 236 aa  138  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  30.43 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  31.27 
 
 		 346 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  31.11 
 
 		 247 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  31.27 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  31.27 
 
 		 346 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  29.78 
 
 		 241 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  29.78 
 
 		 241 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  29.78 
 
 		 241 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  24.21 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  26.56 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  26.21 
 
 		 471 aa  66.6  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  27.88 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  23.81 
 
 		 489 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  27.46 
 
 		 329 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  29.34 
 
 		 266 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  29.94 
 
 		 266 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  27.87 
 
 		 372 aa  52.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  27.41 
 
 		 307 aa  51.2  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  25.27 
 
 		 359 aa  51.2  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  23.5 
 
 		 359 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  27.62 
 
 		 658 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  27.01 
 
 		 331 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  27.91 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  26.33 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  24.68 
 
 		 488 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  26.02 
 
 		 806 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  25.96 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  23.71 
 
 		 881 aa  48.5  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  24.5 
 
 		 577 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  29.11 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  30.18 
 
 		 331 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  29.46 
 
 		 436 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  29.11 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  25.12 
 
 		 350 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1601 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  30.69 
 
 		 166 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  24.04 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0580  hypothetical protein  25.87 
 
 		 195 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000209593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2867  cytochrome c nitrite reductase  29.09 
 
 		 177 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  26.9 
 
 		 540 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  19.77 
 
 		 883 aa  45.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  30.33 
 
 		 157 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  28.91 
 
 		 270 aa  44.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2898  cytochrome c family protein  27.22 
 
 		 330 aa  44.3  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808902  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  23.16 
 
 		 426 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  26.82 
 
 		 413 aa  44.3  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  26.18 
 
 		 333 aa  43.9  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2664  hypothetical protein  24.48 
 
 		 262 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  32.82 
 
 		 299 aa  43.9  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>