31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2381 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  55.56 
 
 		 270 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  59.76 
 
 		 270 aa  311  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  55.69 
 
 		 266 aa  268  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  55.69 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  32.39 
 
 		 658 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  33.98 
 
 		 689 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  28.93 
 
 		 729 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  29.41 
 
 		 577 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  32.98 
 
 		 464 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  25 
 
 		 615 aa  49.3  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  27.37 
 
 		 566 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  34.02 
 
 		 655 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  26.54 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  31.87 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  27.37 
 
 		 566 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  27.78 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  30.28 
 
 		 670 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  30.14 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  26.49 
 
 		 471 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  26.55 
 
 		 540 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  26.26 
 
 		 571 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  32.65 
 
 		 688 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  26.11 
 
 		 662 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  27.48 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  27.34 
 
 		 768 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  31.63 
 
 		 757 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  30.92 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  26.56 
 
 		 789 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  30 
 
 		 455 aa  42.7  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  32.52 
 
 		 489 aa  42  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>