24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3379 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  75.53 
 
 		 783 aa  1206    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  100 
 
 		 789 aa  1634    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  38.12 
 
 		 744 aa  432  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  36.67 
 
 		 768 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  31.7 
 
 		 946 aa  234  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  58.73 
 
 		 595 aa  144  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  29.62 
 
 		 534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1601 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  29.95 
 
 		 1106 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1110 aa  104  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  26.36 
 
 		 812 aa  104  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  43.17 
 
 		 500 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  26.94 
 
 		 611 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  25.31 
 
 		 554 aa  99  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  24.58 
 
 		 593 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1294 aa  82  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  24.47 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  27.74 
 
 		 729 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  29.41 
 
 		 266 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  26.4 
 
 		 266 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  21.77 
 
 		 867 aa  47.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  25.86 
 
 		 307 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  32.69 
 
 		 270 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0862  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  44.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>