55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2748 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  100 
 
 		 1601 aa  3304    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  40.89 
 
 		 595 aa  337  9e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  32.22 
 
 		 593 aa  172  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  29.67 
 
 		 554 aa  149  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  27.57 
 
 		 534 aa  144  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  27.31 
 
 		 812 aa  144  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1110 aa  142  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  29.87 
 
 		 1106 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  27.09 
 
 		 611 aa  132  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1294 aa  127  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  31.14 
 
 		 783 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  28.95 
 
 		 500 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.43 
 
 		 744 aa  116  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  27.2 
 
 		 490 aa  116  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.72 
 
 		 768 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  28.86 
 
 		 789 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  26.9 
 
 		 946 aa  90.5  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  33.92 
 
 		 1024 aa  76.3  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.43 
 
 		 1482 aa  75.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  41.05 
 
 		 1376 aa  65.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  34.76 
 
 		 1314 aa  63.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  42.53 
 
 		 1011 aa  63.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 635 aa  63.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  30.84 
 
 		 635 aa  62.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  31.98 
 
 		 646 aa  62.8  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  31.06 
 
 		 634 aa  62  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  31.58 
 
 		 1189 aa  58.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1022 aa  57.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  21.67 
 
 		 658 aa  57.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  28.85 
 
 		 464 aa  56.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  38.82 
 
 		 1004 aa  56.2  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  29.45 
 
 		 1814 aa  54.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1422  PKD domain containing protein  41.57 
 
 		 400 aa  53.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  23.28 
 
 		 315 aa  53.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  38.2 
 
 		 488 aa  51.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  27.11 
 
 		 867 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  27.87 
 
 		 873 aa  52  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 2082 aa  49.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  24.23 
 
 		 488 aa  49.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  21.62 
 
 		 316 aa  50.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  26.54 
 
 		 461 aa  48.9  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.7 
 
 		 351 aa  48.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3452  hypothetical protein  29.01 
 
 		 719 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153341  normal  0.241088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  33.04 
 
 		 835 aa  47.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 884 aa  47.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  31.53 
 
 		 706 aa  47.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  22.1 
 
 		 916 aa  47.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  24.66 
 
 		 488 aa  47.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  30.51 
 
 		 489 aa  47.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  25.45 
 
 		 489 aa  47  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  22.37 
 
 		 427 aa  46.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  22.59 
 
 		 315 aa  46.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  25.39 
 
 		 615 aa  46.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  23.66 
 
 		 505 aa  46.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  36.03 
 
 		 969 aa  45.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>